高通量方法扩展了突变影响细胞的观点

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癌症中有数百万种突变和其他基因变异,而与无害的“乘客”相比,这些突变中的哪一个、是一个有影响的肿瘤“驱动因素”,以及每个驱动因素对癌细胞的作用,一直是一项具有挑战性的工作。

许多研究,依赖于定制的、耗时的、特定于基因的方法,这些方法为给定突变的更广泛的功能影响,提供了一维视角。或者,计算预测可以提供功能性的见解,但这些发现必须通过实验加以证实。

高通量方法扩展了突变影响细胞的观点

现在一份报告中,麻省理工学院和哈佛大学博德研究所的一个研究小组,公布了一种大规模、高分辨率的方法,可以同时对大量蛋白质编码突变进行功能性评估。

这种方法,可以返回丰富的表型信息,并有可能用于研究任何基因的任何突变癌症,也许还有其他疾病。他们的结果,通过概念验证实验获得癌细胞系,也表明个体突变不仅对其受影响的个体,有一系列的影响基因。

同时,也涉及到分子途径和细胞整体状态,并为长期接受的将癌症突变分为所谓的“驱动因素”和“乘客”,增加了细微差别。“当你观察病人肿瘤的基因数据时,你会发现,大多数与癌症相关的突变实际上是相当罕见的,这意味着我们对这些突变的作用知之甚少,”Broad’s cancer Program的杰西·博姆(Jesse Boehm)说到。

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